Version 4, last updated by lena at June 19, 2007 19:02 UTC
Milestones KW26
IO
- Exportfunktionen: einzelne Sequenz (Nukleotid/AS), ganzes Genom
- GC3 wie GC, nur 3. Position (nicht GC-skew)
- GC3-Plot über gesamtes Genom (Intergenische Bereiche mit 0 auffüllen)
- Kommandozeilenoptionen für Statistik-Output
- Design der Dokumentation (Tutorial) beginnen und einchecken in Ordner docs/tutorial
GUI
- Exportfunktionen FASTA (Sequenz Nukleo, Sequenz AS, ganzes Genom)
- Textfenster: Clipboard-Anbindung sowie Abspeichern als Datei ("Export Text window content" o.ä.)
- JScrollPane: für Infobox und LinearView
- Color Settings Bugs fixen
- Codon Usage eigenes Fenster
- Filename und Spezies-Name in Titelleiste
- Tools->Show statistics ... als JCheckBoxMenuItem
- "Save as ..." umbenennen in "Save as Image..."
- Labels für overall GC content, Genomgröße (IO-Leute fragen, welche Funktionen diese Daten zurückgeben)
VIS
- MouseListener fixen X
- Gen-Info in Infobox schreiben X (GUI)
- GC3-Plot integrieren
- Dragging der gelben Markierung (Wunsch)
- Statistiken Darstellung an- und abschaltbar machen X (GUI)
- Gelbe Markierung sollte evtl. feste Größe haben, damit diese auch bei großen Genomen zu sehen ist. (sehr clever, danke!) X
- preferred size bestimmen
Alle:
Try-catch nur da wo's sinnvoll ist verwenden!
Weiterhin Kommentierung nicht vergessen bzw. nachholen! Der Javadoc-Output wird auch ein Teil der Dokumentation sein, und mit in die Bewertung einfließen!
ABGABE BIS DIENSTAG 26.06. 09:00 UHR